Футбольный клуб «Химик» был основан в 1946 году в городе Дзержинске. Изначально команда создавалась как заводской коллектив при химическом заводе имени Я. М. Свердлова, крупнейшем предприятии города.
Первыми названиями клуба были «Азот», «Команда города Дзержинск» и «Завод им. Свердлова». В 1946 году команда дебютировала в третьей группе Приволжской зоны РСФСР чемпионата СССР.
В 1964 году клуб получил на постоянной основе название «Химик», которое отражало профиль градообразующего предприятия и стало символом команды на долгие годы. В разные годы 1950-х клуб под различными наименованиями выступал в чемпионатах РСФСР или чемпионате Горьковской области, где быстро стал одним из лидеров.
Значительный вклад в становление «Химика» внёс Александр Григорьевич Шевляков, который в 1950-х годах был играющим тренером команды. Под его руководством клуб добился первых серьезных успехов на региональном уровне.
В 1960 году под названием «Заря» клуб впервые принял участие в чемпионате СССР среди команд дивизиона «Б» (третий по силе дивизион советского футбола). Это стало важной вехой в истории клуба, ознаменовав выход на всесоюзный уровень соревнований.
На протяжении 1960-х, 1970-х и 1980-х годов «Химик» регулярно выступал в третьей по силе лиге советского футбола, закрепив за собой статус одной из сильнейших команд Горьковской области. В дивизионе «Б» дзержинцы выступали до 1970 года.
